Контакты в облаке синхронизируются с контактами в телефоне, поэтому в облаке их удалить нельзя. Сначала удалите ненужные контакты на устройстве, затем обновите их в приложении Вторая память. Для этого:
1. Зайдите в раздел Контакты и нажмите на настройки в правом верхнем углу
2. Нажмите Обновить
После этого контакты в МТС Вторая память будут такими же, как в вашем телефоне.